La distribución del neumococo es mundial y se presenta en todos los climas y estaciones. En los países de clima templado, se observa un aumento de la incidencia de neumonía neumocócica en el invierno y en la primavera.

El neumococo forma parte de la microbiota normal humana y se puede encontrar en la boca y la faringe, especialmente de niños y personas mayores de sesenta años. La transmisión se produce a través de gotas de saliva.